Diadema paucispinum se caracteriza por un peristoma grande y placas genitales lisas. Presenta un tubo anal negro y largas espinas huecas y frágiles, de hasta 65 mm. Su color es morado oscuro con reflejos azulados bajo el agua, sin marcas azules ni blancas en el caparazón (Codoceo 1974). El número de placas y tubérculos es menor en comparación con otros miembros de la familia Diadematidae, lo que le da su nombre, “paucispinum” (pocas espinas).